Existen distintas librerías con las que desarrollar aplicaciones con interfaces gráficas de usuario (GUI) en Python. Cada toolkit tiene ventajas y desventajas, la mayoría son multiplataforma (lo cual es un punto notable a favor).
Si vas a realizar una aplicación para un sistema específico, Linux por ejemplo, podrías considerar PyQT o PyGTK. Sin embargo, son entornos muy grandes y la curva de aprendizaje, aunque menos pronunciada que en otros lenguajes, puede ser dura. Yo aprendería wxPython que sirve para casi todo.
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